Bases de dades de Biologia i Biotecnologia

• ISCB Training information Llista de programes de simulació i Biocomputació, cursos, cursos on-line, llibres, etc.
• How to become a bioinformatics Explicció de què és, en què treballa i com arrivar a ser un Bioinformatic
• The World-Wide Web Virtual Library--La més completa guia de pàgines web dedicades a la biologia, classificades per temes. Aquest és un mirror europeu:cuisung.unige.ch/vl/Home.html
• BIOSCI/bionet
• http://www.oup.co.uk/nar/Volume_26/Issue_01/ Un llistat complet de gairebé totes les bases de dades relacionades amb la nostra materia, amb articles comentant el seu contingut i utilitats.

Bases de dades moleculars

• Bases de dades generals
  •  Bioquímica y Biología Molecular en la red   Senzillament genial, hi ha de tot sobre el que ara ens ocupa, el problema és que és un pel lenta.
  •  Pedro's Una colecció de links i serveis útils en biologia molecular (tutorials, guies...). És antiga (del 95), però està força bé
  •  Cambridge School of Biological Sciences Doncs això, l'escola de Cambridge de ciències biògiques.
• Bases de DNA i Proteïnes
  • Seqüències
    • The National Center for Biotechnology Information  També conegut com el GenBank, Aquí hi ha la que possiblement és la base de dades de DNA més completa del món, on es poden fer busquedes per paraules clau, cerques per homologia, prediccions d'estructura i moltes coses més
      • NCBI als EEUU:    Entrez El sistema de búsqueda per paraules clau del Gen Bank
    • European Bioinformatics Institute (EBI-UK) Home Page L'equivalencia al GenBank a Europa, tan complet com ell, però amb l'aventatge de que està més aprop i per tant és més ràpid.
      • SRSWWW at EMBnet/CNB Recerca per paraules clau del EBI situada a Madrit (molt ràpid)
    • DNA Data Bank of Japan (DDBJ) Igual que l'EBI i l'NCBI, però al Japó.
    • NDB 4 bases de dades realcionades amb el DNA :

    - Nucleic Àcid Database : informació estructural

    - a la mode : base de dades de monomers i lligands

    - Structure finder: dona accès a una gran varietat de bases de dades sobre estructura de macromolècules.

    - mmCIF: Arxiu d'informació de clistalografia macromolecular.

    • Genome Sequence Database (GSDB)
    • Genome Database (GDB)

    Aquestes Dues ùltimes es refereixen al progecta genoma humà i aquí hi ha tot el DNA sequenciat de l'espècie humana

• SwissProt (el més usat durant el transcurs de l'assignatura)
• Protein Data Bank (at EBI)
• Protein Data Bank (USA)
• Protein  Information Resource (PIR at Europe)
• PRF HOME PAGE

Tot això són links directes a les bases de dades de proteines que hi ha en els diferents serveis de recerca a Internet

• REBASE Enzims de restricció, tipus, sequencies de tall i metilació, organismes de procedència, etc.
•  Codon Usage Database Informació sobre les preferències dels diferents organismes a l'hora d'usar els diferents codons.

• Motius
  •   DDBASE  Dominis estructurals (Univ. de Cambridge)
  •   Prosite   Diccionari de motius (Suissa)
  •   Motif     Cerques de motius proteics al Japó

• Estructura
  • NRL Protein Structure Database
  • Swiss-Model Servidor automatitzat de modelatge de proteines situat al "Glaxo Wellcome Experimental Research" a Geneva

• Bases genòmiques
  • The Institute for Genomic Research(TIGR) Plana d'un institud de recerca (sensa ànim de lucre) interessat en l'estructura, funcionalitat i l'anàlissis comparatiu de virus, Archeobacteris, Eubacteris i Eucariotes
  • The Sanger Centre : Projects Centra de recerca genòmica dedicat a organitzar els coneixements que tenim sobre genomes (especialment l'humà).
  • Microorganismes
    • TIGR Microbial Database l'apartat dedicat a microorganismes del TIGR comentat abants
    • Pseudomonas Genome Project: Obtaining Sequences Tot el que hi ha seqüenciat de Pseudomonas

• Genomes eucariotes
  • Human Genome Mapping Project Assistència per als bioinformàtics que treballen en el progecta Genoma Humà.
  •  Saccharomyces Genome Database Base de dades de Biologia molecular i de genètica sobre aquest llevat.

• Altres
  •  EcoCyc: Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolism Doncs això: Enciclopedia (i DataBase) de gens i metabolisme d'E.coli
  • http://flybase.bio.indiana.edu/ Base de dades del genòmica de Drosophila
  • http://www.informatics.jax.org Base de dades genètica i genòmica del ratolí de laboratoriç
  • The human Gene Mutation DataBase Colecció de mutacions en gens nuclears "undelaying human inherited disease".
  • International ImMunoGenetics DataBase Base de dades integrada especialitzada en Immunoglobulines, Receptors de cèl.lules T i Complexe Major d'Histocompativilitat de vertebrats

  Bases de dades de bibliografia científica

• Cerques bibliografiques a internet
  • Medline complert
  • Medline de Biologia Molecular
  • BioMedNet

  Totes elles tenen una gran quantitat d'abstracs d'articles sobre Biologia i Medicina, els quals podem consultar lliurement, però haurem de pagar per veure els articles senssers.

• Biblioteques
  • Consultes i cerques en els fons
    •  Catàleg de les biblioteques UAB / Library Catalog
    •  Catàleg col·lectiu ON-Line de les Universitats de Catalunya

• Revistes: Unes quantes revistes relacionades amb la biologia

• Publicacions on-line
   
  • Biblioteca Digital a la UAB:  Decomate